WEKO3
アイテム
A ternary complex model of Sirtuin4-NAD+-Glutamate dehydrogenase
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2005188
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2005188a52a7a45-14a0-4bb9-9519-79debad5e564
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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compbiolchem_74_94.pdf (1.77 MB)
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| Item type | 文献 / Documents(1) | |||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2018-08-06 | |||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||
| 出版社版DOI | ||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2018.03.006 | |||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 10.1016/j.compbiolchem.2018.03.006 | |||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | A ternary complex model of Sirtuin4-NAD+-Glutamate dehydrogenase | |||||||||||||||||||||||
| 著者 |
加藤, 有介
× 加藤, 有介× キハラ, ヒロシ
× 福井, 清
WEKO
271
× 小島, 正樹
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Sirtuin4 (Sirt4) is one of the mammalian homologues of Silent information regulator 2 (Sir2), which promotes the longevity of yeast, C. elegans, fruit flies and mice. Sirt4 is localized in the mitochondria, where it contributes to preventing the development of cancers and ischemic heart disease through regulating energy metabolism. The ADP-ribosylation of glutamate dehydrogenase (GDH), which is catalyzed by Sirt4, downregulates the TCA cycle. However, this reaction mechanism is obscure, because the structure of Sirt4 is unknown. We here constructed structural models of Sirt4 by homology modeling and threading, and docked nicotinamide adenine dinucleotide+ (NAD+) to Sirt4. In addition, a partial GDH structure was docked to the Sirt4-NAD+ complex model. In the ternary complex model of Sirt4-NAD+-GDH, the acetylated lysine 171 of GDH is located close to NAD+. This suggests a possible mechanism underlying the ADP-ribosylation at cysteine 172, which may occur through a transient intermediate with ADP-ribosylation at the acetylated lysine 171. These results may be useful in designing drugs for the treatment of cancers and ischemic heart disease. | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Sirtuin | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Metabolism | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Homology modeling | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Cancer | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Docking | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Ischemic heart disease | |||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Computational Biology and Chemistry 巻 74, p. 94-104, 発行日 2018-03-10 |
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| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 14769271 | |||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA11947228 | |||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA11829786 | |||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Elsevier | |||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | © 2018. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |||||||||||||||||||||||
| EID | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | 337735 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||
