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Prognostic value of partial EMT‐related genes in head and neck squamous cell carcinoma by a bioinformatic analysis
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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k3611_abstract.pdf (181 KB)
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k3611_review.pdf (64.6 KB)
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k3611_fulltext.pdf (2.29 MB)
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| Item type | 文献 / Documents(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2020-07-14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版社版DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1111/odi.13351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 10.1111/odi.13351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Prognostic value of partial EMT‐related genes in head and neck squamous cell carcinoma by a bioinformatic analysis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル別表記 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| その他のタイトル | 部分的上皮間葉転換関連遺伝子による頭頚部扁平上皮癌の予後予測 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル別表記 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| その他のタイトル | Prognostic value of partial-EMT-related genes in head and neck squamous cell carcinoma by a bioinformatic analysis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル別表記 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| その他のタイトル | Prognostic value of p-EMT-related genes in HNSCC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
木曽田, 暁
× 木曽田, 暁
× 卲, 文華× 藤原, 奈津美
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463
× 毛利, 安宏
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1273
× 常松, 貴明
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813
× Jin, Shengjian
× 新垣, 理恵子× 石丸, 直澄
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1721
× 工藤, 保誠
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572
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Objective: Recent studies have revealed that the ability of cancer cells to undergo intermediate state of EMT, partial EMT (p-EMT) poses a higher metastatic risk rather than complete EMT. Here we examined the prognostic value of p-EMT-related genes in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) by bioinformatics approaches. Materials and Methods: We used RNA-seq data of 519 primary HNSCC cases obtained from TCGA database. We compared the expression of p-EMT-related genes in HNSCC tissues with normal tissues. We evaluated the prognostic value of p-EMT-related genes in HNSCC cases by Log-rank test. We examined the expression of p-EMT-, EMT-, and epithelial differentiation-related genes by qPCR. Results: Among p-EMT-related genes that were highly expressed in HNSCC cases, high expression of SERPINE1, ITGA5, TGFBI, P4HA2, CDH13, and LAMC2 was significantly correlated with poor survival of HNSCC patients. By gene expression pattern, HNSCC cell lines were classified into three groups; epithelial phenotype, EMT-phenotype, and p-EMT phenotype. Conclusions: Our findings suggest that p-EMT program may be involved in poor prognosis of HNSCC. SERPINE1, ITGA5, TGFBI, P4HA2, CDH13, and LAMC2 can be used for a prognostic marker. Moreover, HNSCC cells with p-EMT phenotype can be a useful model for investigating a nature of p-EMT. |
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| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Head and neck squamous cell carcinoma | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Partial-epithelial-to-mesenchymal transition | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | prognosis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Oral Diseases 巻 26, 号 6, p. 1149-1156, 発行日 2020-04-11 |
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| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 16010825 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA11631042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | John Wiley & Sons | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 備考 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | 内容要旨・審査要旨・論文本文の公開 本論文は，著者Satoru Kisodaの学位論文として提出され，学位審査・授与の対象となっている。 学位授与者所属 : 徳島大学大学院口腔科学教育部（口腔科学専攻） |
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| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | This is the peer reviewed version of the following article: Kisoda, S, Shao, W, Fujiwara, N, et al. Prognostic value of partial EMT‐related genes in head and neck squamous cell carcinoma by a bioinformatic analysis. Oral Dis. 2020; 26: 1149– 1156., which has been published in final form at https://doi.org/10.1111/odi.13351. This article may be used for non-commercial purposes in accordance with Wiley Terms and Conditions for Use of Self-Archived Versions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | 366623 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 報告番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与番号 | 甲第3611号 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位記番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | 甲口第479号 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与年月日 | 2022-03-23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位名 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位名 | 博士（歯学） | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与機関 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与機関名 | 徳島大学 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
