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AirID, a novel proximity biotinylation enzyme, for analysis of protein–protein interactions
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2008822
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2008822e626a93f-5a29-485b-b81b-c7989b5f972a
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
elife_9_e54983.pdf (4.21 MB)
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.png)
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| Item type | 文献 / Documents(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2021-07-26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版社版DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.7554/eLife.54983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 10.7554/eLife.54983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | AirID, a novel proximity biotinylation enzyme, for analysis of protein–protein interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
キド, コウキ
× キド, コウキ
× ヤマナカ, サトシ
× ナカノ, ショウゴ
× 茂谷, 康
WEKO
684
× シノハラ, ソウタ
× ノザワ, アキラ
× 小迫, 英尊
WEKO
301
× イトウ, ソウヘイ
× サワサキ, タツヤ
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Proximity biotinylation based on Escherichia coli BirA enzymes such as BioID (BirA*) and TurboID is a key technology for identifying proteins that interact with a target protein in a cell or organism. However, there have been some improvements in the enzymes that are used for that purpose. Here, we demonstrate a novel BirA enzyme, AirID (ancestral BirA for proximity-dependent biotin identification), which was designed de novo using an ancestral enzyme reconstruction algorithm and metagenome data. AirID-fusion proteins such as AirID-p53 or AirID-IκBα indicated biotinylation of MDM2 or RelA, respectively, in vitro and in cells, respectively. AirID-CRBN showed the pomalidomide-dependent biotinylation of IKZF1 and SALL4 in vitro. AirID-CRBN biotinylated the endogenous CUL4 and RBX1 in the CRL4CRBN complex based on the streptavidin pull-down assay. LC-MS/MS analysis of cells that were stably expressing AirID-IκBα showed top-level biotinylation of RelA proteins. These results indicate that AirID is a novel enzyme for analyzing protein–protein interactions. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : eLife 巻 9, p. e54983, 発行日 2020-05-11 |
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| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 2050084X | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | eLife Sciences Publications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use and redistribution provided that the original author and source are credited. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | 366537 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
