WEKO3
アイテム
P219L substitution in human D-amino acid oxidase impacts the ligand binding and catalytic efficiency
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2008986
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/20089864030ab3d-0552-4b38-a19e-4df90644115e
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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k3497_abstract_review.pdf (268 KB)
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k3497_fulltext.pdf (1.99 MB)
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| Item type | 文献 / Documents(1) | |||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2021-06-15 | |||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版社版DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1093/jb/mvaa083 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 10.1093/jb/mvaa083 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | NA | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43 | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | P219L substitution in human D-amino acid oxidase impacts the ligand binding and catalytic efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル別表記 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| その他のタイトル | ヒトD-アミノ酸酸化酵素のP219L置換が与えるリガンド結合と触媒効率に対する影響 | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル別表記 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| その他のタイトル | P219L DAO alters ligand binding and catalytic efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
ラシャデー, ワニチャー
× ラシャデー, ワニチャー
× 加藤, 有介× El-Magd, Rabab M. Abou
× 宍戸, 裕二
× Kim, Soo Hyeon
× Sogabe, Hirofumi
× 真板, 宣夫× 頼田, 和子× 福井, 清
WEKO
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Human D-amino acid oxidase (DAO) is a flavoenzyme that is implicated in neurodegenerative diseases. We investigated the impact of replacement of proline with leucine at position 219 (P219L) in the active site lid of human DAO on the structural and enzymatic properties, because porcine DAO contains leucine at the corresponding position. The turnover numbers (kcat) of P219L were unchanged, but its Km values decreased compared to wild-type, leading to an increase in the catalytic efficiency (kcat/Km). Moreover, benzoate inhibits P219L with lower Ki value (0.7-0.9 μM) compared to wild-type (1.2-2.0 μM). Crystal structure of P219L in complex with flavin adenine dinucleotide (FAD) and benzoate at 2.25 Å resolution displayed conformational changes of the active site and lid. The distances between the H-bond-forming atoms of arginine 283 and benzoate and the relative position between the aromatic rings of tyrosine 224 and benzoate were changed in the P219L complex. Taken together, the P219L substitution leads to an increase in the catalytic efficiency and binding affinity for substrates/inhibitors due to these structural changes. Furthermore, an acetic acid was located near the adenine ring of FAD in the P219L complex. The present study provides new insights into the structure-function relationship of human DAO. | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | human D-amino acid oxidase | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | point-mutation | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | active site lid | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | structure–function relationship | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | X-ray crystallography | |||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : The Journal of Biochemistry 巻 168, 号 5, p. 557-567, 発行日 2020-07-30 |
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| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 17562651 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0021924X | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12096002 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA00694073 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Oxford University Press | |||||||||||||||||||||||||||||
| 備考 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | 内容要旨・審査要旨・論文本文の公開 本論文は，著者Wanitcha Rachadechの学位論文として提出され，学位審査・授与の対象となっている。 This is a pre-copyedited, author-produced version of an article accepted for publication in The Journal of Biochemistry following peer review. The version of record Wanitcha Rachadech, Yusuke Kato, Rabab M Abou El-Magd, Yuji Shishido, Soo Hyeon Kim, Hirofumi Sogabe, Nobuo Maita, Kazuko Yorita, Kiyoshi Fukui, P219L substitution in human D-amino acid oxidase impacts the ligand binding and catalytic efficiency, The Journal of Biochemistry, Volume 168, Issue 5, November 2020, Pages 557–567 is available online at: https://doi.org/10.1093/jb/mvaa083 学位授与者所属 : 徳島大学大学院医科学教育部（医学専攻） |
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| EID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | 376550 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||
| 報告番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与番号 | 甲第3497号 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 学位記番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | 甲医第1483号 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与年月日 | 2021-03-23 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 学位名 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位名 | 博士（医学） | |||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与機関 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 学位授与機関名 | 徳島大学 | |||||||||||||||||||||||||||||
