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The Expression Level of HIV-1 Vif Is Optimized by Nucleotide Changes in the Genomic SA1D2prox Region during the Viral Adaptation Process
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2009755
https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/200975533672898-5dd0-44be-826f-3e1aeee2cb5b
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
virus_13_10_2079.pdf (2.98 MB)
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.png)
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| Item type | 文献 / Documents(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2022-04-15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版社版DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.3390/v13102079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 10.3390/v13102079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | The Expression Level of HIV-1 Vif Is Optimized by Nucleotide Changes in the Genomic SA1D2prox Region during the Viral Adaptation Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
駒, 貴明
× 駒, 貴明
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873
× 土肥, 直哉× タケモト, マイ
× ワタナベ, キョウスケ
× ヤマモト, ヒデキ
× ナカシマ, サトシ
× 足立, 昭夫
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1594
× 野間口, 雅子
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246
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | HIV-1 Vif plays an essential role in viral replication by antagonizing anti-viral cellular restriction factors, a family of APOBEC3 proteins. We have previously shown that naturally-occurring single-nucleotide mutations in the SA1D2prox region, which surrounds the splicing acceptor 1 and splicing donor 2 sites of the HIV-1 genome, dramatically alter the Vif expression level, resulting in variants with low or excessive Vif expression. In this study, we investigated how these HIV-1 variants with poor replication ability adapt and evolve under the pressure of APOBEC3 proteins. Adapted clones obtained through adaptation experiments exhibited an altered replication ability and Vif expression level compared to each parental clone. While various mutations were present throughout the viral genome, all replication-competent adapted clones with altered Vif expression levels were found to bear them within SA1D2prox, without exception. Indeed, the mutations identified within SA1D2prox were responsible for changes in the Vif expression levels and altered the splicing pattern. Moreover, for samples collected from HIV-1-infected patients, we showed that the nucleotide sequences of SA1D2prox can be chronologically changed and concomitantly affect the Vif expression levels. Taken together, these results demonstrated the importance of the SA1D2prox nucleotide sequence for modulating the Vif expression level during HIV-1 replication and adaptation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | HIV-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Vif expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | SA1D2prox | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | nucleotide sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | adaptation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | splicing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Viruses 巻 13, 号 10, p. 2079, 発行日 2021-10-15 |
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| 収録物ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 19994915 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | MDPI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY) license (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | 382838 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
