Novel method utilizing bisulfite conversion with dual amplification-refractory mutation system polymerase chain reaction to detect circulating pancreatic β-cell cfDNA

岡田, 朝美; オカダ, アサミ; Okada, Asami; 山田, 美鈴; ヤマダ ヤマシタ, ミスズ; Yamada-Yamashita, Misuzu; トミナガ, ユカリ; トミナガ, ユカリ; Tominaga, Yukari; ジョウ, キョウカ; ジョウ, キョウカ; Jo, Kyoka; 森, 博康; モリ, ヒロヤス; Mori, Hiroyasu; スズキ, レイコ; スズキ, レイコ; Suzuki, Reiko; 石津, 将; イシヅ, マサシ; Ishizu, Masashi; 田蒔, 基行; タマキ, モトユキ; Tamaki, Motoyuki; アケヒ, ユウコ; アケヒ, ユウコ; Akehi, Yuko; 髙士, 祐一; タカシ, ユウイチ; Takashi, Yuichi; コガ, ダイスケ; コガ, ダイスケ; Koga, Daisuke; 下北, 英輔; シモキタ, エイスケ; Shimokita, Eisuke; 谷原, 史倫; タニハラ, フミノリ; Tanihara, Fuminori; 倉橋, 清衛; クラハシ, キヨエ; Kurahashi, Kiyoe; 吉田, 守美子; ヨシダ, スミコ; Yoshida, Sumiko; ミツイ, ユカリ; ミツイ, ユカリ; Mitsui, Yukari; マスダ, シホ; マスダ, シホ; Masuda, Shiho; 遠藤, 逸朗; エンドウ, イツロウ; Endo, Itsuro; 粟飯原, 賢一; アイハラ, ケンイチ; Aihara, Ken-ichi; 香美, 祥二; カガミ, ショウジ; Kagami, Shoji; 安倍, 正博; アベ, マサヒロ; Abe, Masahiro; Ferreri, Kevin; フジタニ, ヨシオ; フジタニ, ヨシオ; Fujitani, Yoshio; 松久, 宗英; マツヒサ, ムネヒデ; Matsuhisa, Munehide; 黒田, 暁生; クロダ, アキオ; Kuroda, Akio

doi:https://doi.org/10.1111/jdi.13806

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Novel method utilizing bisulfite conversion with dual amplification-refractory mutation system polymerase chain reaction to detect circulating pancreatic β-cell cfDNA

https://tokushima-u.repo.nii.ac.jp/records/2010047

名前 / ファイル	ライセンス	アクション
k3641_abstract.pdf (147 KB)
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k3641_fulltext.pdf (1.28 MB)

Item type

文献 / Documents(1)

公開日

2022-07-19

アクセス権

open access

資源タイプ

資源タイプ識別子

http://purl.org/coar/resource_type/c_db06

資源タイプ

doctoral thesis

出版社版DOI

関連名称

10.1111/jdi.13806

出版タイプ

出版タイプResource

http://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43

タイトル

Novel method utilizing bisulfite conversion with dual amplification-refractory mutation system polymerase chain reaction to detect circulating pancreatic β-cell cfDNA

タイトル別表記

その他のタイトル

バイサルファイト変換とARMS PCRを用いた膵β細胞傷害の新規定量法

タイトル別表記

その他のタイトル

Detecting pancreatic β-cell cfDNA

著者

岡田, 朝美

ja	岡田, 朝美
ja-Kana	オカダ, アサミ
en	Okada, Asami

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山田, 美鈴

ja	山田, 美鈴
ja-Kana	ヤマダヤマシタ, ミスズ
en	Yamada-Yamashita, Misuzu

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トミナガ, ユカリ

ja	トミナガ, ユカリ
ja-Kana	トミナガ, ユカリ
en	Tominaga, Yukari

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ジョウ, キョウカ

ja	ジョウ, キョウカ
ja-Kana	ジョウ, キョウカ
en	Jo, Kyoka

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森, 博康

WEKO 732
徳島大学教育研究者総覧 286336/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 80611772

ja	森, 博康 ISNI
ja-Kana	モリ, ヒロヤス
en	Mori, Hiroyasu

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スズキ, レイコ

ja	スズキ, レイコ
ja-Kana	スズキ, レイコ
en	Suzuki, Reiko

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石津, 将

WEKO 1426
徳島大学教育研究者総覧 375080/profile-ja.html

ja	石津, 将 ISNI
ja-Kana	イシヅ, マサシ
en	Ishizu, Masashi

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田蒔, 基行

WEKO 725
e-Rad_Researcher 60624400

ja	田蒔, 基行 ISNI
ja-Kana	タマキ, モトユキ
en	Tamaki, Motoyuki

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アケヒ, ユウコ

ja	アケヒ, ユウコ
ja-Kana	アケヒ, ユウコ
en	Akehi, Yuko

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髙士, 祐一

ja	髙士, 祐一
ja-Kana	タカシ, ユウイチ
en	Takashi, Yuichi

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コガ, ダイスケ

ja	コガ, ダイスケ
ja-Kana	コガ, ダイスケ
en	Koga, Daisuke

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下北, 英輔

ja	下北, 英輔
ja-Kana	シモキタ, エイスケ
en	Shimokita, Eisuke

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谷原, 史倫

WEKO 747
e-Rad_Researcher 90754680

ja	谷原, 史倫 ISNI
ja-Kana	タニハラ, フミノリ
en	Tanihara, Fuminori

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倉橋, 清衛

WEKO 833
徳島大学教育研究者総覧 310684/profile-ja.html

ja	倉橋, 清衛 ISNI
ja-Kana	クラハシ, キヨエ
en	Kurahashi, Kiyoe

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吉田, 守美子

WEKO 518
徳島大学教育研究者総覧 229104/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 40510904

ja	吉田, 守美子 ISNI
ja-Kana	ヨシダ, スミコ
en	Yoshida, Sumiko

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ミツイ, ユカリ

ja	ミツイ, ユカリ
ja-Kana	ミツイ, ユカリ
en	Mitsui, Yukari

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マスダ, シホ

ja	マスダ, シホ
ja-Kana	マスダ, シホ
en	Masuda, Shiho

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遠藤, 逸朗

WEKO 230
徳島大学教育研究者総覧 145663/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 10432759

ja	遠藤, 逸朗 ISNI
ja-Kana	エンドウ, イツロウ
en	Endo, Itsuro

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粟飯原, 賢一

WEKO 1224
徳島大学教育研究者総覧 75205/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 70372711

ja	粟飯原, 賢一 ISNI
ja-Kana	アイハラ, ケンイチ
en	Aihara, Ken-ichi

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香美, 祥二

WEKO 1631
徳島大学教育研究者総覧 60248/profile-ja.html
e-Rad 00224337

ja	香美, 祥二 ISNI
ja-Kana	カガミ, ショウジ
en	Kagami, Shoji

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安倍, 正博

WEKO 1634
徳島大学教育研究者総覧 60265/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 80263812

ja	安倍, 正博 ISNI
ja-Kana	アベ, マサヒロ
en	Abe, Masahiro

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Ferreri, Kevin
フジタニ, ヨシオ

ja	フジタニ, ヨシオ
ja-Kana	フジタニ, ヨシオ
en	Fujitani, Yoshio

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松久, 宗英

WEKO 415
徳島大学教育研究者総覧 205776/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 60362737

ja	松久, 宗英 ISNI
ja-Kana	マツヒサ, ムネヒデ
en	Matsuhisa, Munehide

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黒田, 暁生

WEKO 522
徳島大学教育研究者総覧 229225/profile-ja.html
e-Rad_Researcher 70571412

ja	黒田, 暁生 ISNI
ja-Kana	クロダ, アキオ
en	Kuroda, Akio

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抄録

内容記述

Aims/Introduction: Several research groups have reported methods for quantifying pancreatic beta cell (β-cell) injury by measuring β-cell-specific CpG unmethylation of the insulin gene in circulation using digital droplet PCR or next-generation sequencing. However, these methods have certain disadvantages, such as the need to consider the background signal owing to the small number of target CpG sites and the need for unique equipment.
Materials and Methods: We established a novel method for detecting four CpG unmethylations of the insulin gene using two-step amplification refractory mutation system PCR. We applied it to type 1 diabetes (T1D) patients with a wide range of disease durations and to healthy adults.
Results: The assay showed high linearity and could detect a single copy of unmethylated insulin DNA in experiments using methylated and unmethylated plasmid DNA. The unmethylated insulin DNA level in the type 1 diabetes group, whose β-cell mass was considerably reduced, was similar to that of healthy adults. An inverse correlation was observed between copy number and disease duration in patients with unmethylated insulin DNA-positive type 1 diabetes.
Conclusions: We developed a novel method for detecting unmethylated insulin DNA in circulation that can be performed using a conventional real-time PCR system. This method would be useful for analyzing dynamic profiles of β-cells in human disease such as type 1 diabetes.

キーワード

主題

cell free DNA

キーワード

主題

DNA methylation

キーワード

主題

Quantitative RT-PCR

キーワード

主題

amplification-refractry mutation system PCR

キーワード

主題

Type 1 diabetes

書誌情報

en : Journal of Diabetes Investigation

巻 13, 号 7, p. 1140-1148, 発行日 2022-04-09

収録物ID

収録物識別子タイプ

ISSN

収録物識別子

20401124

収録物ID

収録物識別子タイプ

NCID

収録物識別子

AA12488319

出版者

Asian Association for the Study of Diabetes

出版者

Wiley

備考

値

内容要旨・審査要旨・論文本文の公開
本論文は，著者Asami Okadaの学位論文として提出され，学位審査・授与の対象となっている。
学位授与者所属 : 徳島大学大学院医学研究科（医学専攻）

権利情報

This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial License, which permits use, distribution and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited and is not used for commercial purposes.

EID

識別子

385996

言語

eng

報告番号

学位授与番号

甲第3641号

学位記番号

値

甲医第1535号

学位授与年月日

2022-06-23

学位名

博士（医学）

学位授与機関

学位授与機関名

徳島大学

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2024-12-12 07:38:05.091544

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× 岡田, 朝美

× 山田, 美鈴

× トミナガ, ユカリ

× ジョウ, キョウカ

× 森, 博康

× スズキ, レイコ

× 石津, 将

× 田蒔, 基行

× アケヒ, ユウコ

× 髙士, 祐一

× コガ, ダイスケ

× 下北, 英輔

× 谷原, 史倫

× 倉橋, 清衛

× 吉田, 守美子

× ミツイ, ユカリ

× マスダ, シホ

× 遠藤, 逸朗

× 粟飯原, 賢一

× 香美, 祥二

× 安倍, 正博

× Ferreri, Kevin

× フジタニ, ヨシオ

× 松久, 宗英

× 黒田, 暁生

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